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応用情報技術者 2018年 秋期 午後 問03


ウェーブレット木に関する次の記述を読んで、設問1~4に答えよ。

   ウェーブレット木は、文字列内の文字の出現頻度を集計する場合などに用いられる2分木である。ウェーブレット木は、文字列内に含まれる文字を符号化して、それを基に構築される。特に計算に必要な作業領域を小さくできるので、文字列が長大な場合に効果的である。  例えば、DNAはA(アデニン)、C(シトシン)、G(グアニン)、T(チミン)の4種類の文字の配列で表すことができ、その配列は長大になることが多いので、ウェーブレット木はDNAの塩基配列(以下、DNA配列という)の構造解析に適している。  ウェーブレット木において、文字の出現回数を数える操作と文字の出現位置を返す操作を組み合わせることによって、文字列の様々な操作を実現することができる。本問では、文字の出現回数を数える操作を扱う。   〔ウェーブレット木の構築〕  文字の種類の個数が4の場合を考える。DNA配列を例に文字列Pを“CTCGAGAGTA”とするとき、ウェーブレット木が構築される様子を図1に示す。  ここで、2分木の頂点のノードを根と呼び、子をもたないノードを葉と呼ぶ。根からノードまでの経路の長さ(経路に含まれるノードの個数-1)を、そのノードの深さと呼ぶ。各ノードにはキー値を登録する。  図1では、文字列Pの文字Aを00、文字Cを01、文字Gを10、文字Tを11の2ビットのビット列に符号化して、ウェーブレット木を構築する様子を示している。また、図1の文字列の振り分けは、ウェーブレット木によって文字列Pが振り分けられる様子を示している。
応用情報技術者試験(平成30年度 秋期 午後 問03 図01) ↩設問1
 ウェーブレット木は、次の(1)〜(3)の手順で構築する。  (1) 根(深さ0)を生成し、文字列Pを対応付ける。  (2) ノードに対応する文字列の各文字を表す符号に対して、ノードの深さに応じて決まるビット位置のビットの値を取り出し、文字の並びと同じ順番で並べてビット列として構成したものをキー値としてノードに登録する。ここで、ノードの深さに応じて決まるビット位置は、“左から(深さ+1)番目”とする。   ノードが根の場合は、ビット位置は左から(0+1=1)番目となるので、図2に示すように、文字列P “CTCGAGAGTA”に対応する根のキー値はビット列0101010110となる。
応用情報技術者試験(平成30年度 秋期 午後 問03 図02)
 (3) キー値のビット列を左から1ビットずつ順番に見ていき、キー値の元になった文字列から、そのビットに対応する文字を、ビットの値が0の場合とビットの値が1の場合とで分けて取り出し、それぞれの文字を順番に並べて新たな文字列を作成する。   文字列Pに対応する根のキー値の場合は、ビットの値が0の場合の文字列として“CCAAA”を取り出し、ビットの値が1の場合の文字列として“イ”を取り出す。   ビットの値が0の場合に取り出した文字列内の文字が2種類以上の場合は、その文字列に対応する新たなノードを生成して、左の子ノードとする。取り出した文字列内の文字が1種類の場合は、新たなノードは生成しない。   ビットの値が1の場合に取り出した文字列内の文字が2種類以上の場合は、その文字列に対応する新たなノードを生成して、右の子ノードとする。取り出した文字列内の文字が1種類の場合は、新たなノードは生成しない。   生成した子ノードに対して、(2)、(3)の処理を繰り返す。新たなノードが生成されなかった場合は、処理を終了する。   〔文字の出現回数を数える操作〕  文字列P全体での文字C(=01)の出現回数は、次の(1)、(2)の手順で求める。  (1) 文字Cの符号の左から1番目のビットの値は0なので、文字Cは根から左の子ノードに振り分けられる。左の子ノードに振り分けられる文字の個数は、根のキー値の0の個数に等しく、ウである。  (2) 文字Cの符号の左から2番目のビットの値は1である。(1)で振り分けられた左の子ノードのキー値の1の個数は2で、このノードは葉であるので、これが文字列P全体での文字Cの出現回数となる。   〔文字の出現回数を数えるプログラム〕  与えられた文字列Q内に含まれる文字の種類の個数をσとするとき、あらかじめ生成したウェーブレット木を用いて、与えられた文字列内で指定した文字の出現回数を数えるプログラムを考える。ウェーブレット木の各ノードを表す構造体Nodeを表1に示す。左の子ノード、又は右の子ノードがない場合は、それぞれ、left、rightにはNULLを格納する。
応用情報技術者試験(平成30年度 秋期 午後 問03 表01)
 文字列Qに対応して生成したウェーブレット木の根へのポインタをrootとする。文字列Q内に存在する一つの文字(以下、対象文字という)をビット列に符号化して、整数(0~σ-1)に変換したものをrとする。  このとき、文字列Qの1文字目からm文字目までの部分文字列で、対象文字の出現回数を数える関数rank(root,m,r)のプログラムを図3に示す。  文字の符号化に必要な最小のビット数は、大域変数DEPTHに格納されているものとする。
〔ウェーブレット木の評価〕  文字列Qが与えられたとき、文字列Qの長さをN、文字の種類の個数をσとする。ここで、議論を簡潔にするためにσは2以上の2のべき乗とする。  文字列Qが与えられたときのウェーブレット木の構築時間は、文字ごとにlog2(ク)か所のノードで操作を行い、各ノードでの操作は定数時間で行うことができるので、合計でO(ケ × log2(ク))である。  構築されたウェーブレット木が保持するキー値のビット列の長さの総和は、コである。

設問1:

問題文を見る
図1中のア、図1及び本文中のイに入れる適切な字句を答えよ。

模範解答

ア:10001 イ:TGGGT

解説

解答の論理構成

  1. 文字列の符号化
    【問題文】には「文字列Pの文字Aを00、文字Cを01、文字Gを10、文字Tを11の2ビットのビット列に符号化して、ウェーブレット木を構築する」とあります。
    そこでP=“CTCGAGAGTA” を2ビットごとに並べると、上位ビット(1ビット目)は
    C T C G A G A G T A 0 1 0 1 0 1 0 1 1 0
    となり、根のキー値が “0101010110” になることが【問題文】で示されています。
  2. 根からの振り分け
    根のキー値 “0101010110” を左から走査し、ビットが0の位置の文字を左側、1の位置の文字を右側に順序を保って集めます。
    • 0だった位置(1,3,5,7,10文字目)→ “C C A A A”
    • 1だった位置(2,4,6,8,9文字目)→ “T G G G T”
      【問題文】に示された「ビットの値が0の場合の文字列として“CCAAA”」「ビットの値が1の場合の文字列として“イ”」より、 イ=“TGGGT” で確定します。
  3. 深さ1(右子ノード)のキー値
    右子ノードは “TGGGT” に対応します。深さ1なので【問題文】の規定「ノードの深さに応じて決まるビット位置は、“左から(深さ+1)番目”」より、2ビット目(下位ビット)を並べたものがキー値です。
    T G G G T 1 0 0 0 1
    したがって右子ノードのキー値は “10001”。
    図1中の ア に入る文字列は “10001” となります。
  4. 結論
    ア:10001
    イ:TGGGT

誤りやすいポイント

  • 文字列の順序保持を忘れ、ビット0・1ごとにソートしてしまう
  • 深さに応じたビット位置の数え方(“左から(深さ+1)番目”)を取り違え、1ビット目を再利用してしまう
  • 2ビット符号の上位・下位を逆に読んで “01010…” と “10101…” を取り違える
  • “TGGGT” のGを3個ではなく4個、またはTを1個見落として “TGGG” としてしまう

FAQ

Q: 文字列の順序は本当にそのまま保たないといけませんか?
A: はい。ウェーブレット木は区間数え上げにも使えるため、各ビットで振り分ける際に元の並び順を厳密に維持します。
Q: 深さが増えたときは常に “左から(深さ+1)番目” のビットですか?
A: そのとおりです。深さ0なら1ビット目、深さ1なら2ビット目、…という規則で符号のビットを参照します。
Q: “10001” の後にさらに子ノードはできますか?
A: “10001” 内には0と1が両方あるため、左右それぞれに文字列を分け、種類が1種類にならない限り再帰的に分割を続けることができます。

関連キーワード: ウェーブレット木、2分木、文字列処理、ビット列、符号化

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本文中のウに入れる適切な字句を答えよ。

模範解答

ウ:5

解説

解答の論理構成

  1. 根ノードのキー値
    問題文には「文字列P “CTCGAGAGTA”に対応する根のキー値はビット列0101010110となる。」と明記されています。
  2. 0の個数を数える
    同じく問題文で「左の子ノードに振り分けられる文字の個数は、根のキー値の0の個数に等しく、ウである。」とあります。
    0101010110の各ビットを左から確認すると
    0,1,0,1,0,1,0,1,1,0の計10ビットのうち
    0は1・3・5・7・10番目の5か所です。
  3. よって ウ には5が入ります。

誤りやすいポイント

  • ビット列「0101010110」を2進数の値として解釈してしまい、0の“個数”ではなく“値”で比較してしまう。
  • ビットを左からではなく右から数えて0の位置を取り違える。
  • 「0101010110」を8ビットや12ビットと誤認し、桁数を増減して数えてしまう。

FAQ

Q: 文字列Pを実際に左半分・右半分に分けて数える必要はありますか?
A: いいえ、根ノードのキー値に含まれる0の個数だけで左側に振り分けられる総文字数が分かります。
Q: 0と1の個数を同時に数えた方が安全でしょうか?
A: 問題が求めているのは0の個数だけです。0を数えれば1の個数は全長から差し引いて求められるため、二重作業は不要です。
Q: キー値が長い場合でも同じ手順で良いですか?
A: はい。ビット列が長くても「0の個数を数える → 左側の文字数」とするルールは変わりません。

関連キーワード: ウェーブレット木、ビット列、出現回数、文字列処理

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図3中のエ〜キに入れる適切な字句を答えよ。

模範解答

エ:DEPTH - d オ:r カ:0 キ:count

解説

解答の導き方

目的は図3の空欄に入る語句を決めることです。図3は関数rank(root, m, r) で、与えられた文字(符号化して整数にしたものがr)について、文字列Qの先頭m文字にその文字が何回現れるかを求めます。問題文に次の記述があります:「文字の符号化に必要な最小のビット数は、大域変数DEPTHに格納されている」「ノードの深さに応じて決まるビット位置は、“左から(深さ+1)番目”とする」。これを踏まえて各空欄を導きます。
  1. エ(図3の [a] に対応)
  • 図3の最初の処理はマスクを作るところで、書かれているのは x ← ( 1 を左に [a] ビットシフトした値 ) です。ここで目的は r の「左から d 番目」のビットを取り出すことです。一般に整数のビット操作は右端(最下位ビット)を位置0として扱うため、「左から d 番目」を右端基準のシフト量に変換する必要があります。符号長が DEPTH ビットであれば、右端基準のビット位置は DEPTH - d になります。したがってマスクは 1 を DEPTH - d ビット左シフトして作るべきです。
  • よって エ = DEPTH - d。
  • 例(問題の符号化A=00, C=01, ... でDEPTH=2, r(C)=01, d=1):シフト量は2 - 1 = 1、マスクは10₂、10₂ & 01₂ = 00₂ → 上位ビットは0であると判定できます。
  1. オ(図3の [b] に対応)
  • 次に x ← ( x and [b] ) とあります。マスク x と論理積を取る対象は、取り出したいビットを含む値、すなわち対象文字の符号を整数化した r です。したがって オ = r。
  • マスクとrの AND で当該ビットのみが残り、その後の右シフトで0/1を得ます。
  1. カ(図3の [c] に対応)
  • 図中および本文で、ビット値が0の場合は左の子ノードへ、1の場合は右の子ノードへ振り分けると説明されています(例として「文字Cの符号の左から1番目のビットの値は0なので、文字Cは根から左の子ノードに振り分けられる」)。よって分岐判定はbが0と等しいかどうかを見ます。
  • よって カ = 0。
  1. キ(図3の [d] に対応)
  • ループ内でcountをゼロから増やし、nodep.keyの左からi番目までのビットのうちbと等しいものを数えています。このcountは「次の深さに渡される要素(子ノードに振り分けられる文字)の個数」を表します。rankの計算は深さ毎に対象集合の先頭n個に対して行い、次の深さではその個数に限定して再帰的(反復)に調べるため、次ループのnにcountを代入する必要があります。最終的にノードがなくなったときに返す値も最後に得た個数です。
  • よって キ = count。
結論(図3中の空欄の解答)
  • エ:DEPTH - d
  • オ:r
  • カ:0
  • キ:count
簡単な動作例(問題文の文字列Pを使った追跡)
  • root.key = 0101010110(長さ10)、対象文字Cの符号r = 01、初期n = m = 10。
  • d=1:シフト量 DEPTH - d = 2 - 1 = 1、マスク=10₂、b = (mask & r) >>1 = 0。root.key の先頭10ビット中 0 の個数 count = 5 → n←5。nodep ← nodep.left。
  • d=2:シフト量 0、マスク=01₂、b = (mask & r) >>0 = 1。左子のキー(長さ5)中 1 の個数 count = 2 → n←2。次の nodep は葉なので次に nodep が NULL になり、最終的に返る値 n = 2 が rank の結果(C の出現回数)になります。

誤りやすいポイント

  • rとDEPTHを取り違える:シフト量にrを使う誤りが多いです。シフト量はビット列長(DEPTH)と現在の深さdに基づき決まります。
  • ビットの位置の数え方を間違える:左から数える(1始まり)ことを忘れ、右端基準でd-1を使う誤り。正しくはシフト量 = DEPTH - dです。
  • 左右の振り分け値を逆にする:本文ではビット値0 → 左、1 → 右 と明示されているので、ここを逆にすると全てのカウントが崩れます。
  • n の更新を忘れる、誤った変数を代入する:次の深さで扱う要素数は count に更新しなければなりません(n ← count)。更新しないと次ループで不正確な範囲を調べます。
  • ループのインデックスとkeyの「左からi番目」の対応を確実にする:インデックスの基準(1始まり/0始まり)をコードと設計で統一してください。

FAQ

Q: なぜシフト量がDEPTH - dなのですか?
A: 図3と本文はビットを「左から(深さ+1)番目」で指定します。一方、ビット演算でのシフト量は通常右端(最下位)からの0始まりインデックスです。左からd番目のビットを右端基準に直すとインデックスはDEPTH - dになるためです。例:DEPTH=2, d=1 → シフト量1。
Q: mask & rの対象はなぜrなのですか? nodep.keyと AND を取るべきでは?
A: maskは対象文字rのビットを取り出すためのものです。nodep.keyはノードに対応する並びに沿ったビット列で、forループ内でnodep.keyの各ビットとbを比較してcountを得ます。mask & rにより得たb(0か1か)とnodep.keyの各ビットを比較するのが正しい流れです。
Q: 最後にreturnしているのがnなのはなぜですか?countを返すべきでは?
A: whileループの各反復でnにcountを代入しているため、ループを抜けた時点のnは最後に得たcountの値を保持しています。したがってreturn nは最終的なcountを返すのと同義です。

関連キーワード: ウェーブレット木、ビット演算、ビットマスク、ランク操作(rank)、ビットインデックス

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本文中のク〜コに入れる適切な字句を答えよ。

模範解答

ク:σ ケ:N コ:

解説

解答の論理構成

  • 【問題文】には
    “与えられた文字列Q内に含まれる文字の種類の個数をσとするとき”
    と明記されています。この “σ” が以後の計算量評価でそのまま使われるため、 “文字ごとにlog2(ク)か所のノードで操作を行い”
    の ク には “σ” が入ります。
    ⇒ ク = σ
  • 同じ段落で
    “文字列Qが与えられたとき、文字列Qの長さをN”
    と置いています。よって式
    “合計でO(ケ × log2(ク))である。”
    の ケ には “N” が入ります。
    ⇒ ケ = N
  • 文字が1文字あたり ビットずつ複数レベルに分散してキー値に格納されるので、全体のビット列長は
    。
    【問題文】の
    “構築されたウェーブレット木が保持するキー値のビット列の長さの総和は、コである。”
    に当てはめると
    ⇒ コ =
以上より
ク:σ
ケ:N
コ:

誤りやすいポイント

  • “σ” と “N” の取り違え
    σは“種類数”、Nは“文字列長”です。両者を逆に入れると計算量がO(σ log₂N) となり意味が変わってしまいます。
  • 乗算か指数かの混同
    は “Nとlogを掛ける” 形です。 ではありません。
  • 2のべき乗の前提を見落とす
    “ここで、議論を簡潔にするためにσは2以上の2のべき乗とする” という一文は、深さ= が整数になることを保証しています。これを忘れると “天井関数” 付きの式を誤って書きがちです。

FAQ

Q: なぜ文字ごとに レベルをたどるのですか?
A: 文字を “0…σ−1” の整数に符号化すると、その2進表現は高々 ビットです。ウェーブレット木は各レベルで1ビットずつ消費して分岐するため、1文字あたり必要なノード訪問数が になります。
Q: ビットはメモリ量としてどの程度効率的ですか?
A: 生の配列保存では2ビット/塩基×N= ビット必要です。本問の符号化も2ビットですが、ウェーブレット木はそのまま検索構造を兼ねているため、“追加のインデックスなしで同じオーダ” という点が効率的です。
Q: σ が4以外でも式は変わりませんか?
A: はい。σを一般化しても深さは常に 、総ビット長は となります。σ が2のべき乗でない場合は に読み替えれば同様です。

関連キーワード: ウェーブレット木、出現回数、時間計算量、空間計算量、ビット操作

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